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Hacked by a pro

It seems that my ASL 6.001 box has been hacked from the external interface (the internet).  I have some evidence of a rather well-known hacker [not an oxymoron - just a moron] sniffing my network.  Then today all network functions were running afoul and the source of the trouble was ASL.  Reloading the configuration from backup seemed to do the trick in getting basic network function back, but this does not solve the problem of the integrity of the machien itself.  It appears that there is no feature/function  that one can use to determine which files have been altered on the system.  This I find hard to believe so I'd like to be proven wrong.  

Can anyone help?  
Basically I'm looking for Astaro forensic tools.
Tripwire might do the trick.

Thanks


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